1988年毕业于杭州师范学院外语系，同年担任杭州电子工业学院英文及国际贸易教师，1995年创办中国第一家互联网商业信息发布网站“中国黄页”，1998年出任中国国际电子商务中心国富通信息技术发展有限公司总经理，1999年创办阿里巴巴，并担任阿里集团CEO、董事局主席。
2013年5月10日，辞任阿里巴巴集团CEO，继续担任阿里集团董事局主席。 6月30日，马云当选全球互联网治理联盟理事会联合主席。 10月受邀出任英国首相戴维·卡梅伦的特别经济事务顾问。 2016年5月8日，马云任中国企业家俱乐部主席。
2017年10月28日，马云在个人微博上公布了一张电影海报，并配以大有深意的“那一夜，那一梦”六个字，证实参演影片《功守道》。 2017年12月15日，荣获“影响中国”2017年度教育人物 。
2018年1月17日，马云以个人名义向团结香港基金捐赠5000万港元，以支持教育、青年、创新等领域的政策研究和相关工作。 2018年5月，马云获颁香港大学名誉社会科学博士。 同年10月，马云以2700亿元人民币财富位居2018年胡润百富榜第一位 。
2019年9月10日，马云将不再担任集团董事局主席，由CEO张勇接任。
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